蛋白质组分析平台针对的主要科学问题是动、植物发生、发育及凋亡过程中蛋白质发生什么样的动态变化，包括蛋白质表达、修饰、互作及转换。在技术上，主要是提高蛋白质及蛋白质修饰鉴定的灵敏度及精确度；蛋白质定量的精确度及蛋白质表达和修饰分析的通量。平台的主要目标：1）结合研究所所“一三五”战略目标，从蛋白质组学角度有选择的开展一些主题研究，如细胞分化的分子机理或重大疾病分子机理；2）为遗传发育所及其他科研院所提供蛋白质组学分析服务。
    平台初步构建了完成蛋白质组学实验必须的基本硬件设施，包括一台液相高分辨率质谱系统LTQ-Orbitrap Elite和一台组合型高分辨率质谱仪TripleTOF 5600；还购买了用于样本处理的配套设备，包括制备液相色谱仪，冷冻浓缩仪，小型服务器等。         在蛋白质组的样本制备方面，已建立了溶液酶切、胶上酶切等样本制备方法，为质谱提供包括互作蛋白复合物IP后的考染、银染样本，全细胞样本，动、植物组织样本，微量样本(10微克以下)等。建立并优化了用于大规模样本制备的液相色谱分离方法。建立了分离制备微量样本的Stagetip方法。目前能在24h内鉴定动物细胞系蛋白质7000个以上。          翻译后修饰方面，磷酸化蛋白质组富集、鉴定技术体系已经建立，细胞系样本能鉴定并定量磷酸化位点13000个以上；鉴定并定量泛素化位点4000个以上；建立乙酰化、甲基化蛋白质组质谱鉴定体系。         定量和差异蛋白质组方面，已建立了SILAC(稳定同位素标记)定量、iTRAQ标记定量、N15标记定量蛋白质组技术，并用于动植物样本分析。目前已可提供各种翻译后修饰的定量鉴定服务，包括：
      IP条带鉴定          磷酸化修饰鉴定  泛素化修饰鉴定   甲基化修饰鉴定
     乙酰化修饰鉴定   复杂样本分离鉴定   N15定量    iTRAQ定量
     SILAC(稳定同位素标记)定量     复杂样本各种翻译后修饰的定量

蛋白质组分析平台 负责人：汪迎春    联系电话：64806149, 电邮：ycwang@genetics.ac.cn;
联系人：黄夏禾 联系电话：64807748（办）, 64807661（实）电邮：xhhuang@genetics.ac.cn;
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